bueno... tienes varias opciones. La primera es crear en la partición activa un fichero llamado boot.ini con la información necesaria para que te de a elegir entre un sistema y otro, esto es lo que hace por ejemplo el XP, 2000, NT o 2003. Pero como el 95, 98 y ME no están preparados para ser multisistemas no lo incluyen. Cuando instalaste tus dos sistemas probablemente instalastes primero el 98 y luego el xp de forma que este creo el boot.ini. cuando has formateado e instalado encima has perdido el boot.ini y el 98 no lo ha creado por lo que solo arrancas con éste.
Podrías hacer eso, crear el fichero y usarlo. También podrias recurrir a un gestor de arranque alternativo, hay muchos, te recomiendo que te des una vuelta por google y escribas \"gestor de arranque\" probablemente encuentres algo que te sirva....
y por cierto, respecto a la información que contendría el boot.ini leete esto:
http://support.microsoft.com/default...1%2F5%2F78.ASP
muchisima suerte!! todo tiene arreglo ;)