En cuanto a los ventiladores, para meter aire sólo voy a poner el grande en el lateral y para extraer pondre el de 9 de arriba y otros dos de 9 en la parte baja de la cara posterior (donde van a ir las conexiones) y asi sacan el calor de la fuente y el disco duro.
La placa base sí que va a estar encima de la fuente, lector y disco duro aunque encima de todo esto es donde pondre esa base de 23x24 que a parte de servir de apoyo para la paca base, la aislará un poco del calor ( o eso espero

).
Sobre el color, será metacrilato transparente, sin color vamos.
Gracias PsiloIlmari por lo del metacrilato, por mi zona ya he encontrado un sitio donde lo venden y me lo cortan, solo falta que me digan el presupuesto.
Por cierto será de 3mm seguramente, ¿es poco o no está mal?