mira si es una unidad nueva si le tienes que dar formato pero si es una unidad que ya este creada y la quierasa hacer mas chica o mas grande no le afecta en nada no inporta que sea primaria el Partition Magic solo te permitira hacerla mas chica hasta donde este el espacio vacio sin eliminar ningun archivo.
ya que con Partition Magic puedes fucionar,aplear, cambiar de formato etc.
para mas detalles usa este enlase
http://www.hispazone.com/conttuto.asp?IdTutorial=56