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Sin duda te aconsejo AMD no sólo por que te ahorrarás un dinero, sino que además el rendimiento de los AMD e mayor. Yo siempre he utilizado equipos con micro Intel, sin embargo el ultimo equipo que adquirí fue con micro AMD Athon TM XP 2400 y el rendimiento es bastante bueno. Además AMd son punteros en la tecnología a 64 bits, consiguiendo los mejores rendimientos. De hecho actualmente estoy barajando la posibilidad de adquirir un servidor con placa base dual, y en este campo también están por encima con el AMD Opteron fente al nuevo producto de Intel XEON.

Si quieres mas información prueba a mirar en las páginas de Intel y AMD, no te lo cuentan todo pero te puedes hacer una idea clara.