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Hola buenas:

Deberias tenerlo en el raiz de c:\
Vamos, en el mismo sitio donde encontraste el autoexec.bat.

Igual el problema que tienes es ese, que no tienes config.sys

Mira a ver si en la carpeta Windows tienes alguna copia de ese fichero o en el raiz de c.\\ tienes otro que se llame config.???.

Edita el contenido y lo pasteas aqui. Asi te podremos decir.

Un saludo.